南红玛瑙颜色发暗的原因可分为自然因素和人为因素两大类，具体分析如下：

一、自然因素

水分流失导致折射率变化

南红玛瑙属多孔性矿物，长期不佩戴或保养不当会导致表面水分流失，使光影折射率减弱，从而产生暗淡感。此时可通过再次把玩、泡水或涂油恢复光泽，这种现象类似皮肤包浆。

紫外线照射

长期暴露在阳光下，紫外线会破坏南红中的色素分子结构，导致颜色褪变。尤其红色玛瑙中的氧化铁成分易受紫外线影响。

二、人为因素

化学侵蚀

接触强酸、强碱等化学物质（如化妆品、洗涤剂）或汗液中的盐分，会腐蚀表面或渗透至内部，导致颜色变暗或发黑。

烤色处理不当

通过高温烤制改变颜色的南红，若烤制过度或频繁进行，可能使颜色逐渐变淡。这种处理方式会改变玛瑙内部结构，影响色彩稳定性。

仿制品问题

部分红玛瑙可能被染成红色，但材质并非天然南红，这类仿制品的颜色难以长期保持，可能出现暗淡或发黑现象。

三、其他原因

表面污垢积累：

日常佩戴中灰尘、油脂等污垢附着表面，可能遮盖部分颜色，需定期清洗。

物理磕碰：表面裂纹或颗粒脱落会改变光线的散射效果，导致视觉上的暗淡感。

总结与建议

南红玛瑙颜色发暗多为保养不当或环境因素导致，可通过专业清洗、避免化学接触、减少阳光直射等方式改善。若涉及烤色处理或疑似化学侵蚀，建议咨询专业珠宝店处理。